部分患者空腹服用中藥湯劑后，若出現胃痛、惡心、嘔吐、腹脹等不良反應，應視病情改為飯后服用。但是如治療胃潰瘍的湯藥，可以有效地抑制胃酸分泌，并可在胃壁等部位形保護膜，故此類湯藥最適宜于飯前空腹服用。滋補類中藥最好也在飯前半小時服用，這樣效果更好，利于吸收。湯劑溫度亦適中，不宜過熱或過涼。

熬制湯藥時，可能因為火力過大，加水少或忘記煎煮時間，導致藥汁煎干甚至煎糊。對于藥液煎干尚未糊掉的藥物，加水適量，稍微熬制片刻，仍可服用。但是中藥一旦煎糊，千萬不可服用，干脆倒掉重新煎制。因為煎糊的藥物可能產生其他的功效，如荊芥為解表藥物，糊掉的荊芥就變成了止血的荊芥炭。因此煎煮中藥時應該注意時間、水量以及火候，以避免煎干甚至煎糊。

無論是中藥還是西藥，其作用基礎都是化學物質作用于生物體，如丹參起藥理作用的便是丹參酮，這些化學物質都存在一定副作用。《中成藥臨床應用指導原則》指出，中成藥使用中出現的不良反應一個主要原因就是長期或超劑量用藥，特別是含有毒性中藥材的中成藥，如朱砂、雄黃、蟾酥、附子、川烏、草烏等，過量服用即可中毒。中藥服用應嚴格遵照醫囑，中病即止，更不可私自改變藥量，以免發生超量使用藥物造成的嚴重不良反應。

中藥湯劑相對比較苦澀，所以很多小朋友都不喜歡喝中藥。部分患者在服用中藥湯劑時，加入蜂蜜，改善了苦澀的湯藥味道。這是個不錯的選擇，而且蜂蜜營養豐富，易于吸收，有潤腸潤肺之功。但應注意蜂蜜所含微量元素可能改變藥效。故湯藥中加入蜂蜜（不推薦白糖）適量即可。藥師建議在服用湯藥后含一塊糖果以減少苦澀味道。

如果又要吃中藥又要吃西藥，建議：中西藥盡可能分開服用，并且相隔一個小時左右。不推薦中西藥同時服用，更忌諱用中藥湯劑直接沖服西藥。總的來說，中藥尤其是復方藥物成分極其復雜，同服可能形成絡合物，影響藥物在胃腸道的吸收，甚至和西藥相互作用，形成新的物質，嚴重時導致中毒等事件的發生。如小檗堿可抑制乳酸菌的活力，使其失去助消化能力。因此若無特別要求，中西藥最好分開服用。

中醫藥講究藥食同源，兩者合理應用會起到治療保健的作用。但某些中藥和某些食物的作用具有對抗性，兩者同吃，藥物治療作用減弱。常見的不宜同時服用的例子如下：①服用消食導滯類中藥和健脾益胃的健脾丸時，忌食油膩葷腥；②服用補血藥忌飲茶水，因茶葉中的鞣酸與藥物中的成分易形成不被吸收的復合物，影響治療效果；③服用中藥白術時，不宜食用桃、李子；④菠蘿和橘子不宜與蘿卜（萊菔子）同食，同食可能誘發甲狀腺腫；⑤銀杏不可與魚同食，因其可能產生不利生化反應，小兒尤其要禁忌。