目前市售的藿香正氣類中成藥有藿香正氣水、藿香正氣丸、藿香正氣滴丸、藿香正氣片、藿香正氣軟膠囊、藿香正氣口服液、藿香正氣顆粒、藿香正氣合劑等，雖然同屬藿香正氣類中成藥，但由于劑型不同而使功效略有差異，臨床應辨別使用。

藿香正氣水是液體劑型，由水煮及酒浸制而成，在幾種劑型中療效最為明顯，但由于口感較差而使應用受到限制。服用時可先將藥水倒在杯中，再沖入約30ml左右的溫熱水趁熱飲服，十分鐘后再飲一杯熱水，服后要避風，讓身體微微有汗時最佳。服藥時要忌食生冷、葷腥、油膩、酸辣等食物，對酒精過敏或不能飲酒者應慎用或改用其它劑型。

藿香正氣丸是用煉制過的蜂蜜制成的蜜丸，速度慢而藥力持久。“丸”字在古代有“緩”字之意，即“丸則緩也”，是藥效和緩的中藥制劑，多用于一些慢性病的調養。

藿香正氣最初的制劑是藿香正氣散，散即藥面兒，在中醫學中有“散”者散也的說法，取其有發散之意，藿香正氣片即是用藥面兒壓成的片劑，但散劑不易久藏，藥性容易揮發。

藿香正氣軟膠囊是中藥的新劑型，比丸劑和散劑吸收的快，質地柔滑，容易吞咽，對害怕藥味和吞咽困難者較為適宜。

藿香正氣顆粒、藿香正氣口服液，藥味較小，口感較好，療效相對其它藿香正氣類中成藥效果差一些，但對于懼怕中藥苦味的人來說，不失為一種選擇，尤其適用于兒童服用是其長處。

藿香正氣滴丸是經過多年科學實驗研制開發的高科技新藥劑型，克服了以往劑型內在質量不可控的缺陷，提高了療效。且生物利用度高，起效快，口感舒適，對胃腸道無刺激，容易吞服，氣味淡香而不再刺鼻難聞，口服后5～6分鐘即可發揮作用。