鐵劑主要是在十二指腸及空腸近端以亞鐵離子的形式吸收，胃酸可增加鐵劑的溶解度，促使不被吸收的三價鐵轉化為可被吸收的二價鐵，從而有助于鐵的吸收。

奧美拉唑屬于抑酸劑，可減少胃酸分泌，提高胃內PH值。如果在服用鐵劑時同時服用抑酸劑，特別是強效抑酸劑，必然會影響鐵劑的吸收，降低療效。所以，在服用鐵劑糾正貧血期間最好停用奧美拉唑。

硝苯地平作為最常見的降壓藥，與同樣常見的胃藥奧美拉唑卻不適合同時服用。

雖然兩者同服不沖突，但由于奧美拉唑有酶抑制作用，會增加人體對硝苯地平的吸收，加大降壓過度的風險和藥物不良反應的發生風險。所以兩者最好分開時間段服用。

酮康唑是抗真菌藥物，藥力的釋放也是依賴胃酸分泌。奧美拉唑是脂溶性弱堿性藥物，可能降低酮康唑的生物利用度，減弱其抗真菌作用。

地高辛是常見的強心苷類藥物，需要在酸性環境下才能水解。作為抑酸劑的奧美拉唑會降低胃液酸度，減少地高辛的水解，導致其活性降低或消失。

氯吡格雷屬于抗血小板聚集藥。拉唑類藥物作為質子泵抑制劑，會降低氯吡格雷的活性代謝產物，導致療效降低，其中降低作用最明顯的，就是奧美拉唑。需要聯用時可將奧美拉唑改為泮托拉唑。

雙歧桿菌三聯活菌適用于腸道菌群失調導致的便秘、腹瀉一系列癥狀，這類活菌是需要在酸性環境下才能保持活性，所以在說明書上也明確指出不宜與抑酸劑同服，所以屬于抑酸劑的奧美拉唑是不宜與它同服的。

奧美拉唑屬于弱堿性化合物，在酸溶液中會被快速分解，這也是為什么奧美拉唑會做成腸溶片或腸溶膠囊的原因。

奧美拉唑與酸性藥物聯用可能會發生中和反應，影響藥效。像是鹽酸氨溴索、奧硝唑、維生素B6等都屬于酸性化合物，不適合與奧美拉唑聯用。